Polska Akademia Nauk (PAN) jest finansowana ze środków budżetowych i pozabudżetowych. Środki budżetu państwa przeznaczone na działalność PAN są klasyfikowane w dziale „Szkolnictwo wyższe i nauka” i ujmowane w odrębnej części budżetu państwa „67 Polska Akademia Nauk”. Dysponentem tej części jest minister właściwy ds. szkolnictwa wyższego i nauki.

Źródłem przychodów pozabudżetowych jest w szczególności:

• działalność prowadzona przez jednostki organizacyjne Akademii nieposiadające osobowości prawnej,
• gospodarowanie nieruchomościami PAN.

Akademia prowadzi samodzielną gospodarkę finansową na podstawie rocznego planu finansowego. Uchwala go Prezydium Akademii na wniosek prezesa PAN, a zatwierdza minister właściwy ds.  szkolnictwa wyższego i nauki, który zatwierdza również sprawozdanie z realizacji planu.