Obsługę administracyjną PAN zapewnia Kancelaria Akademii. Podlega ona prezesowi PAN, a jej bieżącą działalnością kieruje kanclerz PAN.

Regulamin działalności Kanclerza Akademii i Kancelarii Akademii

Książka telefoniczna i struktura organizacyjna

W skład Kancelarii Akademii wchodzą następujące komórki organizacyjne.

1. Biuro Finansów i Budżetu
2. Biuro Organizacyjne
3. Biuro Zarządzania Zasobami Ludzkimi
4. Biuro Majątkowe
5. Biuro Prawne
6. Biuro Zamówień Publicznych
7. Biuro Komunikacji
8. Biuro Informatyki i Cyfryzacji
9. Biuro Upowszechniania Nauki i Wydawnictw
10. Biuro Doskonałości Naukowej
11. Biuro Współpracy z Zagranicą
12. Zespół Gospodarczy
13. Zespół Projektów Medialnych
14. Zespół Audytu i Kontroli Wewnętrznej
15. Zespół Zarządzania Kryzysowego i Ochrony Informacji Niejawnych
16. Samodzielne Stanowisko do spraw Bezpieczeństwa i Higieny Pracy

Komórkami kierują dyrektorzy lub osoby wskazane przez kanclerza w drodze indywidualnych decyzji. Na wniosek dyrektora danej komórki kanclerz może powołać wicedyrektora. W skład niektórych komórek wchodzą działy.